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水族箱是鱼类生活的场所，馒头过程中缸内必然会有粪便及残存的鱼饲料，这就会造成水中的有害物质不断增多，破坏水质进而对鱼造成损害。过滤系统可以清理水中的各种有毒物质以保持水质良好。一套完整的过滤系统必须同时具备物理过滤和生化过滤双重功能。
水泵流量与硝化系统的关系。
水泵的作用是为过滤系统提供合适的水循环次数，一方面满足物理过滤的需要，更重要的是满足硝化系统的需要，硝化细菌的特殊之处在于必须依附于生物滤材才能生长繁殖和工作，如果没有滤材，漂在水中的硝化菌是不能工作的，所以水族箱中的硝化细菌大部分都集中在生物滤材上，漂在水中的很少。自然界中大多数细菌则不需要。由于水中的有毒物质是在不断产生的，这就需要硝化系统必须要不断的进行分解，因此保证有足够的水流经生物滤材才能使充分发挥硝化细菌的作用，这就需要一个强大的水循环系统。根据以往经验选择流量是水族箱水体总量5—10倍的泵比较合理。
海洋馆的设计跟一般的建筑有很大的区别，这种区别主要主要是因为它需要的设备和技术支持。海洋馆建筑有很大的一部分是被海洋馆设计的设备所代替，除了一般建筑需要的照明、通风、变电、冷却等系统外，主要的设备系统是水处理系统。
海洋馆的首层地面绝大部分被水体占用，如表演池、鲨鱼池、鲸鱼池、养护池、贮水池、消防水池等，并且各部分水体所要求的洁净度、温度、深度、成分等因素差异不同。而庞大的用于水处理的机械、电器系统，构成了海洋馆设备与技术的主体。
海洋馆作为一种特殊的娱乐性建筑，虽然在我国为数不多，但由于投资巨大，运行费用高，自然风险也大，所以各地在做海洋馆设计时，要慎重，不要贪多、图大。
海洋馆系统设计要点
1.海洋馆建筑的空间处理，需要根据海洋馆温度、湿度、通风等 物理功能要求，确定各区域不同的层高变化；为保证海洋动物 的日照时间，还要合理设置屋顶的开启可采光，这需要考虑平 衡与室内温度、湿度的处理。
3.根据各种海洋动物生活习性，各种观赏水体的配水问题、洁净 度、深度、pH值、成份差异很大，对海洋馆维生系统提出了很 高的要求。
2.动物医院的位置在海洋馆中相当重要，既要保持对海洋馆的隔 离，又要方便快捷。为此，必须在动物展示和表演、养护、医 了三个区域间，设置地下的通道，对通道内水体的循环、标 高、水质进行合理的设计与配置。
4.海洋馆首层有各种不同池体，表演池，养护池，贮水池，鲸鱼 池等。各部分水体所要求的洁净度、温度、深度、成分（海水 或淡水）之间差异很大，需要庞大的水处理和电气系统。
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